Do innych pierwotnych, endogennych zaburzeń snu należą: zaburzenia oddychania w czasie snu, okresowe ruchy kończyn oraz zespół niespokojnych nóg.

1. Bezdechy nocne należą do jednej z najpoważniejszych przyczyn zaburzeń snu i nadmiernej senności w ciągu dnia. Mogą mieć one charakter obturacyjny lub wynikać z braku ośrodkowego napędu oddechowego (często obie te przyczyny występuję jednocześnie). Bezdechy w czasie snu występują szczególnie często u ludzi otyłych, zdecydowanie częściej u mężczyzn w średnim wieku (niektóre badania mówią nawet o 25% mężczyzn po czterdziestym roku życia cierpiących na jakąś formę bezdechu nocnego!).

2. Okresowe ruchy kończyn (mioklonie nocne) oraz zespół niespokojnych nóg są częstymi nocnymi zaburzeniami ruchowymi o zróżnicowanym obrazie klinicznym. Prawdopodobnie są one objawem różnych zaburzeń czynności OUN na poziomie pnia mózgu. Zarówno mioklonie, jak i zespół niespokojnych nóg są zbyt rzadko diagnozowane – mogą być one łatwo przeoczone w sytuacji niezebrania wnikliwego wywiadu.